의과 대학의 Yan Jian 교수와 Deng Xin 교수가 이끄는 노스 웨스턴 대학교와 홍콩시 대학교의 공동 연구팀은 HT-Selex 기술을 사용하여 슈도모나스 시린세 게놈에서 수백 개의 스포츠 토토 사이트 인자의 DNA 서열 결합 특이성을 분석 하고이 식물 병원체의 전체 게놈 스포츠 토토 사이트 조절 네트워크를 추가로 구성했습니다. 이를 바탕으로, 몇몇 알려지지 않은 III 분비 시스템 (T3SS) 조절 단백질이 발견되었으며, 관련 연구를위한 귀중한 데이터 지원과 이론적 기초를 제공했다. 결과는 10 월 2 일 자연 통신 잡지에서 온라인으로 출판되었으며 "Pseudomonas syringae에서 스포츠 토토 사이트 인자의 DNA- 결합 사양의 개요"라는 제목으로 출판되었습니다.

Pseudomonas syringae일반적인 그램 음성 식물 병원체로서 대기, 토양, 물 및 식물 잎 표면과 같은 본질적으로 널리 존재합니다. 그것은 강한 생태 학적 적응성과 큰 표현형 차이를 가진 미생물 그룹의 그룹입니다. 식물 질병의 발생률은 상위 10 개 박테리아 식물 질환 중 1 위를 차지하여 매년 세계 농업 생산에 큰 경제적 손실을 초래합니다. 따라서, Pseudomonas syringae의 분자 메커니즘을 드러내는 것이 특히 시급합니다. 유전자 발현을 조절하는 핵심 요소로서, 스포츠 토토 사이트 인자는 스포츠 토토 사이트 조절에 의해 매개되는 생물학적 과정에서 중요한 역할을한다. 이전에 국내 및 외국 연구자들은 슈도모나스 시린 사의 병원성을 제어하는 ​​스포츠 토토 사이트 인자를 발견했지만,이 유형의 질병의 대규모 발생의 포괄적 인 예방 및 치료에 큰 장애물을 제기 한 게놈 전체 스포츠 토토 사이트 조절 네트워크가 부족한 스포츠 토토 사이트 인자를 발견했습니다.

지수 농축에 의한 리간드의 높은 처리량 전신 진화, HT-Selex,이 기술은 DNA 랜덤 서열 라이브러리 (40 뉴클레오티드 긴 DNA 단편 포함)로부터 표적 물질과 특히 친화적 인 핵산 앱 타머를 스크리닝하는 데 사용될 수있다. Yan Jian 교수가 스웨덴에서 연구하는 동안 높은 처리량에서 DNA- 단백질 상호 작용을 정량화하는 방법입니다. 이 기술은 인간, 쥐 및 과일 파리와 같은 진핵 생물의 스포츠 토토 사이트 인자 연구에 성공적으로 사용되었으며, 이들 종의 전체 게놈 계보의 스포츠 토토 사이트 조절 네트워크를 밝혀내어 이러한 분야에서 과학적 연구를 크게 촉진했다. 그러나, HT-Selex 기술은 원핵 생물에 널리 사용되지 않았으며, 식물에서 가장 중요한 병원성 박테리아 인 Pseudomonas syringae의 스포츠 토토 사이트 조절 네트워크는 또한 매우 불완전하며,이 박테리아의 스포츠 토토 사이트 조절 연구와 병원성 메커니즘의 해석을 크게 방해합니다. 따라서 HT-Selex 기술은 Pseudomonas syringae의 규제 네트워크를 종합적으로 공개하기위한 중요한 기반을 제공합니다.

이 연구는 HT-SELEX 방법을 슈도모나스 시린에의 301 스포츠 토토 사이트 인자 (플랜 A)에 적용했으며, 그 중 100 개는 특정 DNA 서열 특이성을 가졌으며 유사성에 따라 69 개의 ​​다른 패밀리로 분류했습니다 (계획 B). 이들 스포츠 토토 사이트 인자의 DNA 서열 특이제 모델에 기초하여, 연구팀은 FIMO 소프트웨어를 통해 슈도모나스 시린 게 게놈을 스캔하고, 이들 100 개의 스포츠 토토 사이트 인자 및 이들의 다운 스트림 표적 유전자의 게놈 전체 결합 부위를 예측하고, 스포츠 토토 사이트 조절 관계 네트워크를 성공적으로 구성 하였다. 보다 의미있는, 상이한 신호 전달 경로에서 스포츠 토토 사이트 인자 표적 유전자의 농축을 분석함으로써, 연구팀은 다양한 신호 전달 경로에서 조절 단백질을 발견했으며, 그 중 일부는 이전 연구 결과에 의해 확인되었으며, 어떤 경로에서 알려지지 않은 조절 단백질을 발견 하였다. 특히, PSPPH_3618과 같은 박테리아의 주요 병원성 경로 III 유형 III 분비 시스템의 조절 단백질에 대해, 연구팀은 식물 감염과 같은 생리적 실험을 사용하여 추가 기능적 검증을 수행했다.